Каньо-Негро является важным заповедником мирового уровня, на территории которого сохранились влажные почвы. Он жизненно важен для поддержания экологической обстановки северной части страны. Здесь большое разнообразие флоры и фауны, в том числе исчезающие виды.
Во время сухого сезона заповедник становится источником пропитания для тысяч водоплавающих птиц, которые прибывают на эти влажные территории. У некоторых птиц меняется цвет оперения из-за употребления в пищу моллюсков, которые придают ему розоватую окраску. Здесь есть растения и животные, которые не водятся в других районах страны, в том числе доисторическая рыба гаспар, которая считается живым ископаемым.